El plan de estudios de cuatro años de duración, incluye 7 cursos obligatorios y 2 de especialización en las líneas de investigación del programa, 8 seminarios de investigación y la realización de una tesis de grado.

Los cursos obligatorios incluyen actividades de lecturas y análisis de publicaciones, además de tareas y presentación de informes que permitan complementar la adquisición de conocimientos avanzados en energía y medio ambiente, preparando a los estudiantes para el planteamiento, diseño y solución de problemas científico-tecnológicos en los ámbitos del programa.

Los seminarios de investigación requieren de la asistencia obligatoria de los alumnos, y se realizan con una frecuencia quincenal. Se ofrece uno en cada uno de los ocho semestres.

La tesis doctoral consiste en el desarrollo de un proyecto de investigación individual que permita la generación de nuevos conocimientos que deben ser sometidos por el alumno, como autor principal, a una revista indexada WOS. Esta actividad incluye el desarrollo, escritura y aprobación de la tesis, junto con su defensa pública en una presentación oral, de carácter público, ante la Comisión de Tesis de Grado. La investigación y solución de problemas energéticos y ambientales regionales es una alternativa prioritaria, que se complementa con los temas que proponen los profesores del programa.

Durante el desarrollo de su tesis, el estudiante deberá presentar un examen de calificación y un examen de avance. El primero incluye la propuesta y defensa escrita y oral de su tema de tesis ante la Comisión de Tesis. El segundo, es una presentación escrita y oral del avance logrado en el cumplimiento de los objetivos de la tesis y definición del plan de trabajo para completar las actividades de investigación pendientes.

El plan de estudios detallado por semestre es el siguiente: